MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 7472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020247	TA	3	6	1633	1638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020247	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020247	T	6	6	3138	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020247	AAAC	2	8	3166	3173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020247	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020247	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020247	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020247	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020247	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020247	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020247	TATG	2	8	3634	3641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020247	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020247	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020247	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020247	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020247	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020247	AT	3	6	3789	3794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020247	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020247	T	7	7	4131	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020247	ATGG	2	8	4143	4150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020247	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020247	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020247	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020247	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020247	CATA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020247	CT	4	8	7618	7625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020247	ACAA	2	8	7636	7643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020247	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020247	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020247	ATA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020247	CTAT	2	8	8255	8262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020247	TA	3	6	8263	8268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020247	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020247	T	6	6	8334	8339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020247	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020247	ATT	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020247	GT	3	6	10153	10158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020247	ATA	2	6	10166	10171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020247	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020247	ATA	2	6	12176	12181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020247	TA	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020247	GAT	2	6	12239	12244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020247	ATA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020247	TGCC	2	8	14686	14693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020247	AAT	3	9	14697	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020247	A	7	7	14729	14735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020247	AAT	2	6	14747	14752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020247	TTAG	2	8	18425	18432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020247	ACT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020247	T	6	6	22923	22928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020247	A	6	6	24186	24191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020247	AACG	2	8	24211	24218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020247	A	6	6	24233	24238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020247	TAT	2	6	24239	24244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020247	TAAA	2	8	24256	24263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020247	TAT	2	6	24272	24277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020247	ATA	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020247	TGA	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020247	CATA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020247	TAT	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020247	A	6	6	25586	25591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020247	TGTT	2	8	25592	25599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020247	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020247	ATA	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020247	AAAT	2	8	29445	29452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020247	ATT	2	6	29482	29487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020247	ATT	2	6	29495	29500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020247	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020247	TAA	2	6	29532	29537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020247	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020247	TAT	2	6	29602	29607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020247	ATTTT	2	10	29630	29639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020247	T	6	6	30109	30114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020247	T	6	6	30128	30133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020247	CTT	2	6	32193	32198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020247	ATT	2	6	32252	32257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020247	T	6	6	32261	32266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020247	ACTC	2	8	32302	32309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020247	ATGA	2	8	32331	32338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020247	TA	3	6	33703	33708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020247	ATT	2	6	33729	33734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020247	T	7	7	33733	33739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020247	ATT	2	6	33753	33758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020247	AAT	2	6	33764	33769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020247	ATA	2	6	33795	33800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020247	ATA	2	6	33813	33818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020247	T	6	6	33867	33872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020247	AT	3	6	33873	33878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020247	AAC	2	6	33882	33887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020247	AT	4	8	33913	33920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020247	AT	3	6	33943	33948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020247	A	6	6	33971	33976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020247	A	6	6	34005	34010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020247	ATT	2	6	34093	34098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020247	ATTC	2	8	34119	34126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020247	GTA	2	6	34176	34181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020247	TA	3	6	34208	34213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020247	ATT	2	6	34766	34771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020247	TTA	2	6	41071	41076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020247	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020247	TAT	2	6	41107	41112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020247	A	7	7	41153	41159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020247	AAT	2	6	41562	41567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020247	AT	3	6	41578	41583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020247	T	6	6	41599	41604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020247	CAA	2	6	41636	41641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020247	A	6	6	41680	41685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020247	ATG	2	6	42139	42144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020247	ATG	2	6	42165	42170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020247	AT	3	6	44210	44215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020247	T	6	6	48024	48029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020247	GCC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020247	ACC	2	6	48060	48065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020247	CTAG	2	8	48119	48126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020247	TTA	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020247	TTG	2	6	48143	48148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020247	ATT	2	6	48267	48272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020247	TA	3	6	48303	48308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020247	AAT	2	6	48314	48319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020247	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020247	TTTA	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020247	TTA	2	6	48656	48661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020247	TACT	2	8	48696	48703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020247	AT	3	6	48706	48711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020247	TGA	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020247	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020247	AAT	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020247	ACC	2	6	49187	49192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020247	TC	3	6	49196	49201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020247	ATC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020247	CAA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020247	ATC	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020247	TAGA	2	8	49329	49336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020247	ATT	2	6	49393	49398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020247	ATA	2	6	51967	51972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020247	TTTA	2	8	55657	55664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020247	TAG	2	6	55670	55675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020247	A	6	6	60371	60376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020247	A	6	6	60393	60398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020247	AGT	2	6	60781	60786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020247	A	6	6	60787	60792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020247	TA	3	6	68459	68464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020247	TA	3	6	72152	72157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020247	ATT	2	6	72161	72166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020247	ATC	2	6	72282	72287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020247	GGAG	2	8	72324	72331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020247	TCG	2	6	72402	72407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020247	AGG	2	6	72417	72422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020247	ATTT	2	8	72476	72483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020247	GTTCAT	2	12	72503	72514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_020247	ATA	2	6	72560	72565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020247	CG	3	6	72595	72600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020247	CTAA	2	8	72736	72743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020247	TAA	2	6	72790	72795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_020247	TCA	2	6	72874	72879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020247	A	7	7	72888	72894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020247	TTA	2	6	72896	72901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020247	T	6	6	75999	76004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_020247	ATA	2	6	76970	76975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_020247	T	6	6	77062	77067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020247	A	7	7	77134	77140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_020247	TAA	2	6	81018	81023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_020247	A	6	6	81114	81119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020247	ATA	2	6	82651	82656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_020247	ATA	2	6	84996	85001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_020247	AG	3	6	89568	89573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_020247	ATAA	2	8	130477	130484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020247	AT	3	6	130903	130908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020247	TGA	2	6	131819	131824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020247	TA	3	6	135189	135194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020247	T	6	6	135276	135281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020247	AAATAT	2	12	135314	135325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_020247	TCT	2	6	136954	136959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_020247	AT	3	6	137612	137617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020247	TAA	2	6	137678	137683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020247	A	6	6	137705	137710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020247	TAA	2	6	137711	137716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020247	ATT	2	6	138166	138171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020247	AAT	2	6	138187	138192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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